শ্রীল প্রভুপাদ লিখেছেন, “সারা বিশ্বে আধ্যাত্মিক বোঝাপড়ার বিষয়ে শিক্ষা দেওয়ার মতো কোনো প্রতিষ্ঠান নেই। তাই আমরা মায়াপুরে একটি বড় কেন্দ্র খুলতে যাচ্ছি যেখানে এই শিক্ষা আন্তর্জাতিকভাবে দেওয়া হবে। বিশ্বের বিভিন্ন প্রান্ত থেকে শিক্ষার্থীরা এই গুরুত্বপূর্ণ বিষয়ে শিক্ষা নিতে সেখানে যাবে।” মায়াপুর ইনস্টিটিউটের লক্ষ্য মায়াপুরকে উচ্চ শিক্ষা ও প্রশিক্ষণের কেন্দ্র হিসেবে প্রতিষ্ঠা করে শ্রীল প্রভুপাদের এই ইচ্ছা পূরণ করা।
মায়াপুর ইনস্টিটিউট হল আস্তিক দর্শন, অনুশীলন এবং সংস্কৃতির শিক্ষা ও প্রশিক্ষণের জন্য একটি নেতৃস্থানীয় আন্তর্জাতিক কেন্দ্র যা শ্রীল প্রভুপাদের অনুবাদ ও ব্যাখ্যা অনুসারে শ্রী চৈতন্য মহাপ্রভুর শেখানো অপরিহার্য বৈদিক শাস্ত্রে উপস্থাপিত।
ইনস্টিটিউটটি পূর্বসূরি আচার্যদের লেখা, চারটি বৈষ্ণব সম্প্রদায়ের প্রাথমিক বই এবং গুরুত্বপূর্ণ বৈদিক শাস্ত্র বোঝার জন্য উন্নত অধ্যয়নের সুযোগ প্রদান করবে।
এইভাবে বিশ্বের সমস্ত প্রান্তের ছাত্রদেরকে যোগ্য শিক্ষক, প্রচারক, নেতা, ধর্মতাত্ত্বিক এবং পণ্ডিত হতে প্রশিক্ষিত করা হবে যাতে তারা মানবতার জন্য শ্রী চৈতন্য মহাপ্রভুর অনন্য অবদানগুলি বিতরণ করতে পারে।