श्रील प्रभुपाद ने लिखा, “दुनिया भर में आध्यात्मिक समझ के मामले में शिक्षा प्रदान करने के लिए कोई संस्था नहीं है। इसलिए हम मायापुर में एक बड़ा केंद्र खोलने जा रहे हैं जहां यह शिक्षा अंतरराष्ट्रीय स्तर पर दी जाएगी। विश्व के सभी हिस्सों से छात्र इस महत्वपूर्ण विषय में शिक्षा लेने के लिए वहां जायेंगे।” मायापुर संस्थान का लक्ष्य मायापुर को उच्च शिक्षा और प्रशिक्षण के केंद्र के रूप में स्थापित करके श्रील प्रभुपाद की इस इच्छा को पूरा करना है।
मायापुर संस्थान श्री चैतन्य महाप्रभु द्वारा पढ़ाए गए आवश्यक वैदिक ग्रंथों में प्रस्तुत आस्तिक दर्शन, अभ्यास और संस्कृति में शिक्षा और प्रशिक्षण के लिए एक अग्रणी अंतरराष्ट्रीय केंद्र है, जैसा कि श्रील प्रभुपाद द्वारा अनुवादित और समझाया गया है।
संस्थान पूर्ववर्ती आचार्यों के लेखन, चार वैष्णव संप्रदायों की प्राथमिक पुस्तकों और महत्वपूर्ण वैदिक ग्रंथों को समझने के लिए उन्नत अध्ययन के अवसर भी प्रदान करेगा।
इस प्रकार दुनिया के सभी हिस्सों के छात्रों को मानवता के लिए श्री चैतन्य महाप्रभु के अद्वितीय योगदान को वितरित करने के लिए योग्य शिक्षक, उपदेशक, नेता, धर्मशास्त्री और विद्वान बनने के लिए प्रशिक्षित किया जाएगा।